- a -

• about() : model
• acceptable_type() : atom_type
• ad4_solvation() : ad4_solvation
• add() : beads , terms , parsing_struct , terms , recent_history , terms , term_set< T >
• additive() : additive
• append() : strictly_triangular_matrix< T > , appender , model , matrix< T > , strictly_triangular_matrix< T >
• appender() : appender
• appender_info() : appender_info
• apply() : rigid_conf
• array3d() : array3d< T >
• assign() : vec
• assign_bonds() : model
• assign_el() : atom_type
• assign_types() : model
• atom() : atom
• atom_base() : atom_base
• atom_coords() : model
• atom_exists_between() : model
• atom_frame() : atom_frame
• atom_index() : atom_index
• atom_range() : atom_range
• atom_reference() : atom_reference
• atom_rotors() : conf_independent_inputs
• atom_syntax_error() : atom_syntax_error
• atom_type() : atom_type
• atom_typing_used() : precalculate , weighted_terms , model , scoring_function
• aux() : parallel_iter< F, Container, Input, Sync >::aux , parallel_for< F, Sync >::aux , parallel_for< F, true >::aux
• average_num_possibilities() : szv_grid
• axis_frame() : axis_frame